大成功。

　ということで、システム名のフォルダをひとつ作って、そこにIdeaTreeで作成したシステム機能構成図と、プログラム仕様書（テキスト）を保存するようにしてみました。sigmarion IIIには、このフォルダごとコピーし、IdeaTreeのファイルを開いてリンクドキュメントが開くか試したところ、みごと成功しました。あとは、ドキュメントの同期を、SDカードの差し替えで行うか、ActiveSync経由のエクスプローラで行うかを決めれば、お仕事環境の完成です！